Megamente es un extraterrestre con una gran cabeza dotada de extraordinaria inteligencia, con tan sólo ocho días de edad, es enviado a la Tierra por sus padres cuando su planeta natal es destruido. Megamente es un súper villano, que se da cuenta que en lo único que es bueno es siendo malo, así que intenta a lo largo de los años conquistar la Tierra. Sin embargo, todos sus intentos han sido anulados por su archi enemigo, el súper héroe Metro Man. Pero todo cambia un día cuando Megamente mata a Metro Man en medio de uno de sus planes maléficos. Es así como se encuentra de repente sin un enemigo a quien vencer, y descubre que luchar y ser derrotado es su razón de ser, y que el ganar no es realmente divertido, por lo que decide crear un nuevo súper héroe, un oponente más grande, y más fuerte. Éste original anti héroe tendrá así la más grande aventura.