حوزه ی کابل
بزرگترین دریای این حوزه دریای کابل است که از کوتل اونی کوه بابا سرچشمه می گیرد و از غرب به طرف شرق جریان دارد. از شهر کابل، لغمان و ننگرهار می گذرد و در قسمت اتک پاکستان به دریای سند می ریزد.
معاون های دریای کابل : دریای لوگر، پنجشیر، الیشنگ، الینگار و کنر.
حوزه ی آمو
دریای آمو که یونانی ها آن را به نام اکسوس و عربها آن را به نام جیحون یاد کرده اند، بزرگترین دریای این حوزه است که از پامیر خورد سرچشمه می گیرد و در جهیل ارال می ریزد. این دریا از زرقول تا خم آب به طول 1200 کیلومتر سرحد طبیعی میان افغانستان عزیز و جمهوری تاجکستان، ازبکستان و ترکمنستان را تشکیل می دهد. معاون های آن از خاک افغانستان دریای کندز و کوکچه است.
از آب دریای آمو نسبت این که دریا پایین و زمین های مجاور مسیر دریا در خاک افغانستان بلند است، استفاده نمی شود.
حوزه ی هلمند
بزرگترین و طویل ترین دریای افغانستان دریای هلمند است که از دامنه های غربی کوه بابا سرچشمه می گیرد و به طرف جنوب غرب جریان دارد. طول آن 1400 کیلومتر است. معاون های آن دریای موسی قلعه، ارغنداب، ترنک و ارغستان است.
بعضی از دریاها با هلمند یکجا نشده است و در جهیل سیستان می ریزد که عبارتند از : خاشرود، فراه رود، ادرسکن یا هاروت. در کنار دریای هلمند در منطقه ی گرشک نهر بغرا اعمار شده است. این نهر منطقه های نادعلی و دشتی را که در غرب قلعه ی بست واقع است، آبیاری می کند.
حوزه ی هریرود
مهم ترین دریای این حوزه هریرود است که از غرب کوه بابا سرچشمه می گیرد و از شرق به طرف غرب جریان دارد. این دریا از اسلام قلعه تا ذوالفقار سرحد طبیعی بین افغانستان و ایران را تشکیل می دهد. هریرود در مسیر خود ولایت هرات را سرسبز می کند. دریای مهم دیگر این حوزه دریای مرغاب است.
حوزه ی بسته
دریاهایی که از منطقه های مرتفع کوهستانی سرچشمه می گیرد و در یک مسیر بسته جریان دارد و با دریای دیگر یکجا نمی شود، به نام دریاهای حوزه ی بسته یاد می شود، مانند: دریای غزنی که بعد از عبور از شهر غزنی به آب ایستاده ی غزنی می ریزد. دریاهای دیگر این حوزه عبارتند از: دریای بلخاب، دریای سمنگان، دریای اندخوی و دریای قیصار.